更新日志

MyoToolkit 的所有重要更新将记录在此页面。

2026.04 — MyoScore 在线计算器

• 新增浏览器端 MyoScore 在线计算器，无需安装
• 支持上传或粘贴 bulk RNA-seq 原始 count 矩阵，计算全程在浏览器本地完成（数据不上传服务器）
• 自动识别 Gene Symbol / Ensembl ID，按需加载 GTEx 注释字典（约 5.6 万条）完成转换
• 四种 ECharts 可视化：雷达图、MyoScore 条形图、各维度箱线图、结果表（支持 CSV 下载）
• 全屏模式便于大批量队列查看
• 内置 Symbol / Ensembl 两种格式示例数据（5 Healthy + 5 Unhealthy）

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2026.03 — MyoPath

• 开源发布 MyoPath 流水线（GitHub）
• H&E 全切片图像四层组织分割：肌纤维（Cellpose-SAM）、脂肪（像素分类器）、细胞核（watershed）、结缔组织（布尔减法）
• 37 个形态学特征，涵盖五个生物学类别
• 七项病理指标，以 NCI 和 Fiber CV 作为主要生物标志物
• MyoPath Score 复合严重程度评分（外部验证 AUC = 0.873）
• 在两个独立队列的 478 张 WSI 上验证（GTEx n=399，华山队列 n=79）
• QuPath + Python 流水线，支持批处理和命令行操作

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2026.03 — MyoToolkit 网站

• 首次发布统一的 MyoToolkit 文档网站
• 整合 MyoScore、MyoPath、MyoSpectrum 和 ThighMRIseg 至同一平台

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2024.04 — MyoSpectrum

• 发表于 Communications Biology, 2024, 7(1):438
• 1,221 块人源骨骼肌的整合性转录组图谱（9,231 基因）
• 从健康到重度肌病的连续肌病谱系
• 新型特征基因：MGST1、AOX1、FASN、PRKCD、CHRNA1
• CDM、LGMD R12 和 FSHD 队列的临床验证

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2023.06 — ThighMRIseg

• 基于 SegResNet 的 11 块大腿肌肉分割
• 多模态支持（IDEAL、T1、T2、STIR）
• 多种族训练数据（354 例 MRI：中国、芬兰、德国）
• MONAI Label 部署，集成 OHIF 和 3D Slicer