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方法

GWAS-TWAS 整合流程

GWAS 汇总统计 → FUSION TWAS → 基因水平关联

               eQTL 权重 (GTEx v8 骨骼肌, n=803)

GWAS 表型(共 28 个)

  • Strength (5): 握力(左/右)、步速、肌肉无力、握力横截面积
  • Mass (15): 全身去脂体重、四肢瘦体重、躯干/腿/臂去脂体重等
  • LeanMuscle (2): 大腿前/后脂肪浸润(方向反转)
  • Youth (1): 端粒长度(方向反转)
  • Resilience (5): 肌营养不良、其他肌病、肌酸激酶(方向反转)

方向定义

  • direction_v3 = +1: 高表达 → 健康
  • direction_v3 = -1: 高表达 → 不健康(评分计算时反转)

数据集

来源样本数描述
GTEx803健康对照(尸检)
GEO668多个肌病研究
Myofin154Titinopathy、IBM 队列
HuashanMuscle97DM1、LGMD 中国队列
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